أنشئت هيئة تطوير منطقة مكة المكرمة عام 1421هـ،بهدف النهوض بمهمة التطوير والتنمية في منطقة مكة المكرمة من خلال إعداد المخططات التطويرية الهيكلية والإقليمية والاستراتيجية للمنطقة ووضع دراسات وبرامج التطوير وتنفيذ مشاريع التطوير الكبرى التي أعلن عنها صاحب السمو الملكي الأمير عبدالله بن عبدالعزيز ــ رحمه الله ــولي العهد نائب رئيس مجلس الوزراء رئيس الحرس الوطني آنذاك في الرابع والعشرين من رمضان 1425هـ، وعلى رأسها مشروع تطوير منطقة جبل عمر ومشروع تطوير مستشفى أجياد ومشروع تطوير جبل الكعبة ومشروع تطوير جبل خندمة، ومشروع تطوير منطقة الشامية ومشروع تطوير طريق الملك عبدالعزيز بمكة المكرمة . 

ومرت مسيرة التطوير بمنطقة مكة المكرمة بعدة مراحل مختلفة استطاعت الهيئة خلالها بوضع استراتيجيات وقواعد العملية التخطيطية في مدينة مكة المكرمة ما بين عام 1423هـ، وعام 1430هـ، ، والتي تضمنت المخطط الاستراتيجي والمخطط الإقليمي ثم المخطط الشامل لمكة المكرمة والمشاعر المقدسة فيما سبق، ومن ثم وجهت الهيئة بوصلة اهتماماتها نحو محافظات المنطقة من خلال تنفيذ العديد من المبادرات والمشاريع التطويرية والتنموية بهدف رفع كفاءة الخدمات المقدمة للأهالي وزوار تلك المحافظات. 

وتضمنت المرحلة من عام 1431هـ الى 1437هـ  مشروع معالجة وتطوير الأحياء العشوائية بمنطقة مكة المكرمة وتفعيل المخطط الإقليمي لمنطقة مكة المكرمة، والمخططات الهيكلية لأحياء مكة المكرمة، ومشروع الملك عبدالله بن عبدالعزيز لإعمار مكة، ومشروع النقل العام في مدينة مكة المكرمة. 

وتعكف الهيئة من عام 1437هـ وحتى الان على وضع واعتماد الخطة الاستراتيجية لتطوير منطقة مكة، واستكمال مشروع معالجة وتطوير الأحياء العشوائية بمنطقة مكة المكرمة، وعقد الشراكات مع القطاع الخاص، بالإضافة الى تفعيل المخطط الإقليمي لمنطقة مكة المكرمة.